На протяжении пути движения животного груза его обслуживание производится представителем грузоотправителя, сопровождающего груз. В процессе грузовой перевозки он располагается в служебном помещении специализированного вагона и исполняет обязанности, прописанные в Правилах перевозок грузов железнодорожным транспортом с сопровождением и охраной.

По договоренности грузоотправителя и перевозчика, сопровождающим грузовую перевозку сотрудникам могут выделяться отдельные вагоны, за дополнительную их оплату  грузоотправителем. Как правило, данные условия перевозки  применяются при транспортировке животных на большие расстояния.  При грузовой перевозке, водопой животных осуществляется на станциях, указанных организацией предоставляющей услуги по транспортировке, в летнее время не меньше двух раз в день, в зимнее и переходное время не меньше одного раза.

После отправления животных со станции водопоя, соответствующая служба данной станции информирует о продолжении грузовой перевозки следующую станцию, предоставляющую водопой на маршруте. Отказ от водопоя животных сотрудником, сопровождающим груз, или осуществление процедуры водопоя фиксируется в журнале проводника путем внесения соответствующей записи.

При отказе от питья животными, или при выявлении общего или частного случая заболевания животных, в процессе грузовой перевозки, сопровождающие животных представители грузоотправителя, в  письменном виде информируют (с помощью начальника станции) службу Госветнадзора района (города), где расположена данная станция.

Умерщвление заболевших животных на протяжении всей грузовой перевозке запрещено.

Все происшествия, связанные с  задержками состава с животными в течение грузовой перевозки,  выгрузки каких либо животных на станции, фиксируются путем составления соответствующего акта представителем службы Госветнадзора и представителя грузоотправителя, сопровождающего животных. Дубликат акта и заключение службы Госветнадзора прикрепляется к перевозочным документам. В накладной на груз станция, осуществившая выгрузку животных, ставит отметку об оформлении акта и всех затратах грузового перевозчика по проведению необходимых работ с заболевшими животными.

По окончании грузовой перевозки отправитель груза компенсирует все дополнительные затраты, связанные с обслуживанием заболевших животных, перевозчику на базе отметок в накладной. Служба Госветнадзора и отправитель груза информируются заранее о завершении грузовой перевозки и прибытии состава под выгрузку на конечную станцию. После выгрузки грузоотправитель обязан принять соответствующие меры по очистке вагона от навоза и остатков подстилки.

Если станция назначения находится на карантине, по заявлению грузоотправителя или по решению службы Госветнадзора данного района, груз перенаправляется на другую станцию.