Оплата за грузоперевозку производится по самому короткому маршруту, обусловленному используемым тарифом, проходящему через пограничные станции, занесенные в накладную. В случае грузоперевозки через иные транзитные станции, по более короткому маршруту, отличному от пути следования, описанному в накладной, расчеты производятся в соответствии с самым коротким маршрутом, проходящим через эти станции.

Все платежи и штрафы за грузоперевозку по железным дорогам стран, из которых и в которые направляется груз, производятся в принятой у них валюте. Порядок оплаты в этом случае определяется внутренними правилами железнодорожных структур данных стран.

Во время грузоперевозок по транзитным дорогам внос платежей и выплата штрафов производится по транзитным тарифам, предусмотренным для данного вида перевозки.

Правила внесения провозных платежей на станциях отправления или доставки устанавливаются железнодорожными структурами, которые осуществляют отправление и соответственно прием транспортируемого груза.

Между странами, участвующими в Едином транзитном тарифе (ЕТТ), и странами не участвующими в нем, действуют принятые Международные транзитные тарифы (МТТ).  В транзитной оплате учитываются такие параметры как характер и масса перевозимого груза, скорость его провоза, вид отправки. Принятая валюта МТТ - швейцарский франк.

Оплата, за провоз груза по транзитным железным дорогам, начисляется в зависимости от протяженности данных дорог.  При начислении платы, если транспортировка груза производится мелкими отправками или повагонно, расчет производится с округлением массы груза до ста килограмм. Полученная к оплате сумма округляется до полных сантимов, по правилам округления, в большую или меньшую сторону.

Если грузоперевозка повагонно и мелких отправок должна производиться на повышенной скорости движения, за тариф к оплате принимается стоимость транзитного провоза данного груза на небольшой скорости увеличенная на пятьдесят процентов. Оплата за провоз груза на пониженных скоростях прописана в МТТ.

Для других видов перевозок, таких как транспортировка автомобилей, малогабаритных грузов, быстро портящихся продуктов и т.д., в МТТ предусмотрены соответствующие  правила расчета транзитной оплаты.

Помимо рассмотренных выше видов платежей в МТТ предусмотрены тарифные  ставки за перегрузку груза на пограничных станциях, переоформление сопровождающих груз документов, за задержку состава на транзитных путях по вине грузоотправителя  и т.д.

Таким образом, транзитные платежи оплачиваются грузоотправителем за провоз груза по железным дорогам страны отправителя, грузополучателем за перемещение груза по территории страны получателя. Оплата за грузоперевозку по транзитным железнодорожным путям взимается с отправителя или получателя груза по их договоренности.